Генетический анализ позволяет решать основные проблемы и частные задачи генетики. Он может быть успешным только при наличии большого разнообразия форм изучаемого вида, для чего создаются генетические коллекции. Для решения всех генетических задач используют различные подходы и методы, специфическим методом генетического анализа является гибридологический метод.
Даже краткое знакомство с биологией некоторых объектов говорит о необходимости знания их биологических особенностей, что помогает и облегчает проведение генетического анализа, позволяет грамотно подбирать исходный материал для скрещиваний, выбирать методы анализа, увеличивающие его разрешающую способность. Пределом разрешения при генетическом анализе является возможность экспериментально определять наиболее близкие расстояния между мутациями и редкие частоты мутирования отдельных генов.
Задачи генетического анализа проще и быстрее решаются на модельных объектах, на которых проверяются гипотетические генетические модели, разрабатываются новые методы анализа, которые затем используются на других объектах; они служат тест-системами при оценке действия мутагенных и других факторов.