04.02.2011

Расшифрован геном животного с рекордно большим числом генов

Интернациональная группа биологов расшифровала геном микроскопического членистоногого Daphnia pulex.

Дафнии посчастливилось стать первым ракообразным с секвенированным геномом. Составленная последовательность невелика (всего 200 млн пар оснований), однако содержит рекордно большое количество генов — не менее 30 907. У человека, напомним, на три миллиарда пар оснований приходится «всего» около 23 000 генов, кодирующих белки.

Причиной непропорционального увеличения числа генов исследователи называют интенсивную дупликацию. «По нашим оценкам, скорость дупликации в три раза превышает показатели у других беспозвоночных и на 30% превосходит значение, характерное для человека», — отмечает руководитель работ Джон Колборн (John Colbourne) из Индианского университета в Блумингтоне. Размер генома ракообразного поддерживается на невысоком уровне за счёт сокращения длины интронов — участков ДНК, которые считаются частью генов, но не содержат информации о последовательности аминокислот протеина.

При внимательном рассмотрении последовательности было установлено, что треть всех генов D. pulex не имеет известных аналогов. При этом дафния опережает всех беспозвоночных с секвенированными геномами по числу содержащихся в последовательности генов, аналогичных человеческим.

Последнее обстоятельство позволяет надеяться на то, что дафния будет гораздо чаще использоваться в качестве модельного организма. Ракообразное прекрасно подходит для изучения реакции водной экосистемы на разного рода загрязняющие вещества, а теперь у специалистов появляется возможность оценить влияние загрязнителей на здоровье человека.

Полная версия отчёта опубликована в журнале Science.

Дмитрий Сафин

Источники:

1. КОМПЬЮЛЕНТА