НОВОСТИ    БИБЛИОТЕКА    СЛОВАРЬ-СПРАВОЧНИК    КАРТА САЙТА    ССЫЛКИ    О САЙТЕ

21.10.2009

Расшифрован геном двух лабораторных штаммов кишечной палочки

Биологи из США, Франции и Южной Кореи секвенировали геном двух популярных штаммов бактерий Escherichia coli, которые применяются в экспериментах по изучению эволюции и рекомбинантных белков.

Бактерии E. coli
Бактерии E. coli

Самые важные с практической точки зрения типы бактерий E. coli — K-12 и B — используются в исследованиях около 90 лет. Тип К-12 был выделен в 1922 году в Пало-Альто (Калифорния, США), а его геном расшифровали еще в 1997 году. Для того чтобы восстановить историю бактерий типа В, авторам пришлось просмотреть огромный объем публикаций; в результате выяснилось, что первая колония E. coli этого типа была получена в Институте Пастера (Франция) в 1918 году.

Расшифровав геномы двух штаммов бактерий типа В, исследователи сравнили их с известным вариантом последовательности К-12. Геномы, по словам авторов, содержат приблизительно 4,6 млн пар оснований и практически повторяют друг друга: для 92% всей последовательности сходство составляет более 99%. «Самым интересным нам показалось то, что отличающиеся пары оснований распределены по геному неравномерно», — рассказывает участник исследования Сергей Маслов из Брукхэвенской национальной лаборатории (США).

Разделение изученных штаммов — REL606 и BL21(DE3) — относится к 1959 году. Их лабораторная история хорошо документирована, однако исследователи заметили, что она не может объяснить появление всех 426 отличий между последовательностями. По их мнению, в 60-х годах прошлого века при обмене штаммами между лабораториями произошла ошибка (один образец промаркировали неверно). Как только это было установлено, все встало на свои места: появление каждого отличия между геномами удалось соотнести с каким-либо лабораторным экспериментом.

Свои выводы ученые изложили в трех статьях ([1], [2], [3]), которые готовятся к публикации в издании Journal of Molecular Biology.

Дмитрий Сафин


Источники:

  1. КОМПЬЮЛЕНТА






Генетики нашли в ДНК мужчин следы древней «войны кланов»

Европейцы и азиаты посветлели независимо друг от друга

Современные высшие растения возникли в результате сдвига экспрессии генов

Генетики нашли «семью», состоящую из 13 миллионов человек

Прочитали рекордный по длине геном мексиканской амбистомы - 32 миллиарда пар нуклеотидных оснований

ДНК человека, умершего в 1827 году, восстановили без его останков

Генетики изучили жителей Новой Гвинеи

Ученые добавили две новые буквы в генетический код

В наших генах есть два «неандертальских процента»

Сколько у вас хромосом? История одной мутации

Инвестиции в редактирование генома

Распространение артритов объяснили исходом человека из Африки

Обнаружены гены, отвечающие за чувствительность к магнитному полю Земли

Вредные мутации в геноме усиливают влияние друг друга

Найдены 6 500 генов, отличающие мужчин от женщин

Антропологи извлекли ДНК древних людей из пещер без костных останков

Расшифровка генома ячменя принесла больше вопросов, чем ответов

Сибирские генетики сделали первые шаги к управлению фотосинтезом

Александр Баев – один из пионеров исследований генома человека

215 петабайт в одном грамме ДНК




© Злыгостев Алексей Сергеевич, подборка материалов, оцифровка, статьи, оформление, разработка ПО 2013-2018
При копировании материалов проекта обязательно ставить активную ссылку на страницу источник:
http://genetiku.ru/ 'Genetiku.ru: Генетика'

Рейтинг@Mail.ru