Скрещивание, при котором испытываемые линии или сорта объединяются между собой во всевозможные комбинации (полные диаллельные скрещивания) или только в части комбинаций (неполные диаллельные скрещивания), называется диаллельным. Оно применяется для оценки специфической комбинационной способности небольшого числа линий после предварительной оценки их общей комбинационной способности в скрещиваниях по системе топкросс. Если в полных диаллельных скрещиваниях n-го числа линий используются реципрокные комбинации, то число возможных комбинаций будет равно n(n - 1). Для сокращения объема работ применяются неполные диаллельные скрещивания, когда материнская форма скрещивается только с частью отцовских, при этом разные отцовские формы участвуют в скрещиваниях с разными материнскими.