Анализ совместного наследования нескольких признаков проводят с целью определения локализации генов, контролирующих эти признаки, принадлежности их к одной или к разным группам сцепления, выявления неаллельных взаимодействий, а также для получения анализаторов, используемых в дальнейшем анализе. Изучение совместного наследования нескольких признаков - первый этап работы, предшествующий решению задачи локализации генов в определенной группе сцепления и картирования хромосом. На этом этапе, как правило, отсутствуют анализаторы и анализ приходится проводить на потомках F2.