Обычно пользуются двумя методами хранения. Ауксотрофы (в том числе со вставками Tn10) и множественно маркированные штаммы с относительно стабильным генотипом можно хранить в столбиках во флакончиках при комнатной температуре. Для мутантов со вставками Tn5, у которых накапливаются дополнительные копии этого транспозона, данный метод непригоден. Такие мутанты, штаммы Hfr и штаммы с нестабильными геномами рекомендуется хранить при низкой температуре (-70°С), как это описано ниже.
Б. Хранение фагов
Лизаты фага P22 (методика 2) обычно стабильны при 4°С в хорошо забуференной среде с кальцием и магнием. Лизаты мутанта HT124 фага P22 (мутант, характеризующийся повышенной частотой трансдукции) несколько менее стабильны - возможно, из-за изменения структуры капсида под действием мутации HT. Лизаты фага λ (см. методику 2) можно хранить при 4°С с каплей CHCl3. Титр такого лизата, однако, может за год упасть на порядок. В течение длительного времени препараты фагов P22(HT) и λ хранят при низкой температуре, как это описано ниже.