15.08.2014

Сибирская сенсация. Ученые обнаружили бактерию с неизвестной ДНК

Ученые Новосибирского НИИ туберкулеза обнаружили микобактерию с неизвестным науке ДНК-кодом. Ее получили в ходе обследования одной из пациенток института. Исследователи не исключают, что в их распоряжении оказался уникальный штамм, «прописавшийся» в Сибири.

Научные сотрудники НИИ туберкулеза в лаборатории генодиагностики ведут изучение уникальной микобактерии, обладающей неизвестной науке ДНК. С помощью передового лабораторного оборудования — секвенатора последнего поколения — ученым удалось прочесть с высокой точностью 99,5% последовательности ДНК ее генома. У новосибирских исследователей есть основания утверждать, что они имеют дело с уникальным штаммом, характерным именно для этого региона.

Ольга Альховик, научный сотрудник НИИ туберкулеза: "За время одного запуска секвенатора мы смогли прочитать больше 40 млн пар нуклеотидов генома этой бактерии. И выяснили, что на 0,5% длины генома обнаруженный нами микроорганизм отличается от известного науке. 0,5% с точки зрения микробиологии — это много. Стоит сказать, что геном человека отличается от генома мыши всего на 3%. Так что мы, очевидно, имеем дело с прежде неизвестным генотипом."

Судя по всему, штамм, обнаруженный учеными, характерен именно для Сибири. Какое практическое применение может иметь это открытие?

Ольга Альховик, научный сотрудник НИИ туберкулеза: "Все мы знаем об особых разновидностях вирусов, пришедших в Россию из, например, Юго-Восточной Азии и поражающих гораздо большее число людей по сравнению с широко распространенными, привычными. Так и тут — изучение новой микобактерии, особенностей ее сопротивляемости препаратам, не исключено, откроет новые возможности в лечении туберкулеза."

Вообще, рассказывает Ольга Ивановна, таких «местных» патогенов в последнее время выявляется все больше. И, чтобы найти способ борьбы с ними, ученые все чаще идут на смелые эксперименты, а зачастую даже сами создают новые бактерии.

Так, в этом году новосибирские исследователи совместно с канадскими коллегами начали серию экспериментов по конструированию нового микроорганизма путем скрещивания двух видов бактерий — обычной туберкулезной и древнейшей арктической Colwellia psychrerythraea, которая миллионы лет существует в условиях экстремально низких температур, но погибает в привычных для нас климатических условиях.

Татьяна Петренко, д. м. н., заместитель начальника НИИ туберкулеза по науке: "Смысл эксперимента в том, что ДНК арктической бактерии и ДНК микобактерии туберкулеза, соединяясь, дадут новый штамм, быстро погибающий в организме человека, не причиняя ему особого вреда и одновременно вырабатывая у него антитела к туберкулезу. То есть возбудитель заболевания становится вакциной против него."

Выявление нового, сибирского штамма со временем поможет начать выпуск препарата, побеждающего даже те бактерии, которые сейчас устойчивы к воздействию известных науке лекарств, а значит, вывести лечение от туберкулеза на принципиально новый этап. Но произойдет это не скоро.

Ольга Альховик, научный сотрудник НИИ туберкулеза: "Я бы пока вообще не стала делать из нашего открытия сенсацию. Ведь только на полную расшифровку генома нашей бактерии может уйти год. Затем эти данные нужно обобщить, проанализировать. И уже далее на их основе начинать работу над лекарством нового поколения. А уже на этот процесс могут уйти годы."

Между тем сибирские врачи давно бьют тревогу в связи с ростом заболеваемости туберкулезом, причем такими его формами, на которые обычные лекарства уже не действуют.

Антонина Яковлева, врач-бактериолог: "Конечно, это тенденция не только сибирская или российская, но и мировая. За последние десять лет в разы выросло количество больных туберкулезом с так называемой множественной лекарственной устойчивостью. Сейчас такие формы заболевания поддаются лечению препаратами второго ряда, то есть с большей активностью и широким спектром действия. Но со временем теряют эффективность и они."

По данным медиков, в Новосибирской области доля невосприимчивых к обычным лекарствам пациентов составляет около 7%, и для врачей это тревожный знак. Причем речь, скорее всего, идет о заражении больных именно микобактериями, циркулирующими на территории региона. Возможно, как раз той их разновидностью, которая и была обнаружена в ходе недавних исследований.

В последнее время в Новосибирском НИИ туберкулеза прошла целая серия экспериментов в области изучения генома бактерий. Результатом должно стать создание нового мощного лекарства от туберкулеза.

Юлия Лобанова

Источники:

1. smartnews.ru