Некоторые гены ранее невозможно было картировать из-за отсутствия в них фенотипически обнаруживаемых мутаций. К их числу относится, например, ген рРНК Schizosaccharomyces pombe. Удалось сконструировать химерную плазмиду с этим геном, а также маркером LEU2 Sacch. cerevisiae, который экспрессируется и в клетках S. pombe. При трансформации Leu- - ауксотрофа последнего вида были отобраны прототрофные трансформанты, у которых плазмида включалась в хромосому в результате гомологичной рекомбинации по локусу рРНК. В этот локус оказался встроенным и маркер LEU2. При этом появилась возможность провести обычный генетический анализ, регистрируя расщепление по маркеру LEU2, и картировать место его интеграции в хромосому (т. е. локус рРНК) по отношению к другим, ранее картированным генам [51].