У сбалансированных аллополиплоидов, у которых наборы хромосом обоих родоначальных видов удвоены, происходит нормальная попарная бивалентная конъюгация хромосом, полученных от каждого из родителей (аутосиндез). При наличии гомологичных аллелей в наборах обоих видов при аутосиндезе отсутствует выщепление рецессивов в потомстве гетерозигот (рис. V.1).
Рис. V.I. Схема образования гамет у гетерозиготного амфидиплоида при аутосиндезе. 1 - хромосома одного вида, 2 - хромосома другого вида
Если у амфидиплоида, изображенного на рис. V.1, один из доминантных аллелей - А - мутирует к а, то в его потомстве возможно расщепление и появление рецессивной формы с частотой 1/4 (3А:1а) (рис. V.2).
Рис. V.2. Схема вышепления рецессивов у гетерозиготного амфидиплоида при аутосиндезе в случае возникновения рецессивной мутации в одной из хромосом. 1 - хромосома одного вида, 2 - хромосома другого вида
Однако регулярное прохождение аутосиндеза и образование бивалентов происходит достаточно редко. Чаще наблюдается чаcтичная гомология отдельных хромосом или участков хромосом, принадлежащих разным наборам, вследствие чего в мейозе образуются мультиваленты и униваленты, приводящие к нарушению правильного расхождения хромосом.