Следующий этап исследований группы О. П. Самариной (1965-1967 гг.) включал детальную характеристику 30S-частиц. Было показано, что при ультрацентрифугировании фиксированных 30S частиц в градиенте плотности CsCl (по А. С. Спирину) они взвешиваются в виде чрезвычайно гомогенного пика с плотностью 1,4 г/см3, что соответствовало прямо определенному в них соотношению белок : РНК.
РНК 30S-частиц оказалась весьма чувствительной к РНКазе. Она легко гидролизовалась почти полностью, причем практически с той же скоростью, что и свободная РНК. Иными словами, белок 30S-частиц очень слабо защищал РНК от РНКазы. Отсюда можно было предположить, что РНК располагается не внутри частиц, как в рибосоме (там она в значительной мере защищена от РНКазы), но на их поверхности. Далее оказалось, что 30S-частицы могут связывать дополнительную РНК, если проинкубировать их со свободной гяРНК- Кинетика гидролиза этой дополнительно связанной РНК и собственной РНК частиц РНКазой не отличалась. Это наблюдение служило дополнительным аргументом в пользу локализации РНК на поверхности 30S-частиц.
30S-частицы легко разрушались при повышении концентрации NaCl до 1-2 М, но при последующем диализе к исходному раствору происходила их реконструкция. При электронной микроскопии частицы выглядели как относительно гомогенные компактные образования с диаметром около 20 нм. Наконец, были определены размеры РНК ЗОБ-частиц, и оказалось, что они невелики. Выделенная из частиц РНК седиментировала с константой седиментации 4-6 S, что соответствует РНК длиной в 100-200 нуклеотидов.
Возникло явное противоречие. С одной стороны, в состав 30S-частиц входила почти вся гяРНК ядра. С другой стороны, размеры гяРНК варьируют от 1000 до десятков тысяч нуклеотидов, т. е. во много раз превышают размеры РНК 30S-частиц. Мы предположили, что 30S-частицы - это мономеры, образующиеся из более сложных структурных образований, и стали искать возможности проверки этой гипотезы.