Одним из свойств последовательностей-вставок (IS-элементов) и транспонируемых элементов, обусловливающих устойчивость к лекарственным препаратам, является их способность вызывать образование делеций (и других перестроек) (Kleckner et al., 1979; Ross et al., 1979). Исходя из этого свойства, можно получать набор делеций в интересующей области. Наличие таких делеций можно использовать для генетического картирования, а также просто применять в качестве стабильных (неревертирующих) генетических маркеров при отборе.